C'est comme pour les autres basses sauf que tu n'as pas les frettes pour régler la justesse, donc je te conseille de :
1- accorder très précisément ta corde à vide
2- régler la justesse en te calant sur la 12ème case, à l'harmonique
3- recommencer au point 1 jusqu'à ce que les deux soient parfaits.
Si les harmoniques ne tombent pas pile sur les repères, c'est lié à la précision de fabrication de ta basse mais ce n'est pas trop grave, sachant qu'avec une fretless tu pourras corriger toi-même en jouant.